Using ISSR markers in determination of genetic relationship between 2n = 54 and 2n = 60 cytotypes of Nannospalax xanthodon (Nordmann, 1840) (Mammalia, Rodentia) from Central Anatolia Использование ISSR маркеров в определении генетической связи между 2n = 54 и 2n = 60 цитотипами Nannospalax xanthodon (Nordmann, 1840) (Mammalia, Rodentia) из Центральной Анатолии


Creative Commons License

YAĞCI T., Şen E., GURBANOV R.

Russian Journal of Theriology, cilt.17, sa.2, ss.100-107, 2018 (SCI-Expanded) identifier

  • Yayın Türü: Makale / Tam Makale
  • Cilt numarası: 17 Sayı: 2
  • Basım Tarihi: 2018
  • Doi Numarası: 10.15298/rusjtheriol.17.2.06
  • Dergi Adı: Russian Journal of Theriology
  • Derginin Tarandığı İndeksler: Science Citation Index Expanded (SCI-EXPANDED), Scopus
  • Sayfa Sayıları: ss.100-107
  • Anahtar Kelimeler: Cytotype, ISSR, ISSR, Nannospalax xanthodon, Nannospalax xanthodon, Turkey, Турция, Цитотип
  • Bilecik Şeyh Edebali Üniversitesi Adresli: Evet

Özet

36 образцов 2n = 54 и 2n = 60 цитотипов Nannospalax xanthodon из Центральной Анатолии, Турция, были впервые проанализированы с использованием ISSR маркеров. Анализ выявил 112 полос ISSR, 101 из которых были полиморфными. Из двадцати ISSR праймеров были выбраны семь: ((AG)8 T, (GGAGA)5, (GACA)4, (TG)8 A, (CAG)5 GC, (CAG)4 AC and (GA)8 AC)). Праймеры (AG)8 T и (GA)8 AC создавали специфические полосы для 2n = 54 и 2n = 60 и были наиболее информативными для различения цитотипов. По результатам кластерного анализа (UPGMA) генетически близкие цитотипы образуют 3 группы, наиболее высокое разнообразие отмечено для цитотипа 2n = 60. Наши результаты показали, что маркеры ISSR можно использовать в качестве простого и надежного молекулярного инструмента для оценки генетического разнообразия в цито- типах Nannospalax при низких генетических дистанциях. A total of 36 samples of 2n = 54 and 2n = 60 cytotypes of Nannospalax xanthodon, distributed in the Central Anatolia region of Turkey, were analyzed for the first time by using inter-simple sequence repeat-polymerase chain reaction (ISSR-PCR) technique. The analysis revealed 112 ISSR bands, 101 of which were polymorphic. Seven ISSR primers ((AG)8 T, (GGAGA)5, (GACA)4, (TG)8 A, (CAG)5 GC, (CAG)4 AC and (GA)8 AC)) were optimized from total 20 primers. (AG)8 T and (GA)8 AC primers were most informative to distinguish cytotypes by producing specific bands for 2n = 54 and 2n = 60. The cytotypes in genetically close relationships were separated into three different groups by UPGMA cluster analysis, in which, the highest genetic diversity was measured for 2n = 60. Our results showed that ISSR markers can be used as a simple and reliable molecular tool, for the estimation of genetic diversity in cytotypes of Nannospalax at low range genetic distances.