TD-DFT and NBO Analyses of L-P1yroglutamic Acid


KUŞ N., ILICAN S.

Bilecik Şeyh Edebali Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi, vol.5, no.2, pp.64-74, 2018 (Peer-Reviewed Journal) identifier

Abstract

In this study, L-pyroglutamic acid (L-PGA) conformers were optimized at the density functional theory (DFT) by using B3LYP/6-311++G(d,p) level of approximation and also, barrier energy was calculated using potential energy curves. L-PGA has four conformers with minimum energies in stable form. Conformer I has the most stable form. Conformers II, III and IV are 3.5, 12.6 and 25.6 kJ mol−1 with the relative electronic energy, respectively. Natural bond orbital (NBO) analysis was performed using NBO 3.1, as implemented in Gaussian Programme. The excitated state energies of L-PGA were calculated solving the time-dependent Schrödinger equation for the wavefunction for L-PGA and calculations were done using time-dependent density functional theory (TDDFT)
Bu çalışmada, L-piroglutamik asit (L-PGA) molekülünün konformasyonları yoğunluk fonksiyon teorisi(DFT) B3LYP/6-311++G(d,p) seti yaklaşımı ile optimize edilmiş ve potansiyel enerji eğrilerinden bariyerenerjileri hesaplanmıştır. L-PGA, minimum enerjiye sahip kararlı durumda dört konformasyonu olup, I.konformasyonun en kararlı yapıda olduğu bulunmuştur. Molekülün II, III ve IV. konformasyonlarının bağılelektronik enerjileri farkı, sırasıyla 3.5, 12.6 ve 25.6 kJ mol−1 olarak hesaplanmıştır. Doğal bağ orbital (NBO) analiziile Gaussian programına entegre NBO 3.1 programı ile incelenmiştir. Schrödinger kuantum mekanik denklemleri ileL-PGA molekülünün dalga fonksiyonu çözülerek ve zamana-bağlı yoğunluk fonksiyonel teorisi (TD-DFT)kullanılarak, uyarılma durum enerjileri hesaplanmıştır.