SKBR3 meme kanseri hücre hattında zebularinin apoptotik yolakta görev alan kaspaz-3, kaspaz-8, ve kaspaz-9 üzerine olan etkisinin incelenmesi

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Bilecik Şeyh Edebali Üniversitesi, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, MOLEKÜLER BİYOLOJİ VE GENETİK ANABİLİM DALI, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2017

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: MERVE ÇELEN

Danışman: Onur Eroğlu

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

DNA metil transferaz inhibitörü (DNMTi) olan nükleotid analogları apoptoz ile ilişkili genlerin ve metilasyon ile susturulan tümör baskılayıcı genlerin ekspresyonunu yeniden düzenleyebilir. Böylece, tümör hücrelerinde apoptoz oluşumu tetiklenebilir. DNA metil transferaz inhibitörü olan (sitidin analogu) zebularin bu ajanlardan birisidir. Bu çalışmada zebularinin SKBR-3 meme kanseri hücre hattında sitotoksisite ve apoptoz mekanizması üzerine olan etkilerini analiz etmeyi amaçladık ve bu çalışma literatürde bu konudaki ilk çalışma olduğundan önemlidir. Çalışmada kullanılan SKBR-3 hücreleri %10 FBS ve %1 penisilin/streptomisin içeren DMEM besiyerinde uygun kültür ortamında büyütülmüştür. Zebularinin hücre canlılığı, hücre büyümesi, hücre transformasyonu ve hücre göçü üzerine etkilerinin araştırılması için, sırasıyla MTT deneyi, sağkalım deneyi, soft-agar koloni oluşum deneyi ve yara iyileşmesi deneyi gerçekleştirilmiştir. Aynı zamanda, apoptotik mekanizmadaki etkilerini anlamak için, bisülfit modifikasyonu sonrasında metilasyon spesifik HRM (MS-HRM) ile kaspaz-3, kaspaz-8 ve kaspaz-9'un metilasyon analizleri gerçekleştirilmiştir. Elde edilen bulgular neticesinde zebularinin hücre canlılığını, hücre büyümesini (p<0,0001), hücre göçünü (p<0,001) ve hücre transformasyonunu (p<0,001) önemli derecede azalttığı gözlenmiştir. Ayrıca, zebularin 48 saatlik tedavi sonrasında hücre canlılığını %47'ye düşürmektedir. Uygulanan dozda zamanda zebularine SKBR-3 hücrelerinde kaspaz-3, kaspaz-8 ve kaspaz-9 genlerinde metilasyon seviyelerinde önemli değişikliklere neden olmamaktadır. Bu sonuçlar neticesinde zebularinin kemoterapide kullanılabileceğine dair destekleyici sonuçlar elde edilmiştir ve literatürde zebularinin SKBR3 hücreleri üzerine etkilerinin araştırılmasına yönelik yapılan ilk çalışma olması nedeniyle özgün bir nitelik taşımaktadır. Fakat etki mekanizmasının daha iyi bir şekilde anlaşılabilmesi için gelecekteki çalışmalarda kaspaz-bağımlı apoptoz mekanizmasının aydınlatılması gerekmektedir.